Tras su expulsión de la Asociación Nacional Republicana (ANR), el liberalismo emitió una constancia oficial en la que certifica que el exmandatario no figura en su padrón de afiliados, dejando en evidencia que actualmente no pertenece a ninguna de las dos principales agrupaciones políticas del país.

El documento fue expedido por la Dirección de Organización del PLRA y lleva la firma de Félix Manuel Ayala, actual presidente del Tribunal Electoral Independiente (TEI). La certificación establece expresamente que Santiago Peña Palacios no pertenece al liberalismo ni se encuentra registrado en su padrón partidario.

Peña había militado durante aproximadamente 21 años en el PLRA antes de abandonar sus filas para incorporarse al Partido Colorado en octubre de 2016, durante el gobierno de Horacio Cartes. Su afiliación a la ANR fue aprobada formalmente el 9 de noviembre de ese año, lo que le permitió posteriormente disputar la candidatura presidencial colorada y llegar al Palacio de López en agosto de 2023.

Sin embargo, su trayectoria dentro del coloradismo terminó abruptamente el 10 de noviembre de 2026, cuando el Tribunal de Conducta de la ANR resolvió expulsarlo mediante la Resolución N.º 10/2026. La decisión fue adoptada apenas cuatro días después de su destitución mediante juicio político, en medio del escándalo financiero de Ueno Bank, que derivó también en su imputación penal y prisión preventiva.

De esta manera, el exmandatario pierde su afiliación colorada después de una década y recibe, al mismo tiempo, la confirmación oficial de que tampoco conserva vínculos partidarios con el liberalismo. Peña permanece recluido en el Regimiento Escolta Presidencial, mientras enfrenta una investigación penal por presunta lesión de confianza y administración en provecho propio.