La máxima instancia judicial dejó sin efecto una decisión del Tribunal de Apelación Multifuero de Presidente Hayes, mediante la cual los miembros María Elena Meza y Gustavo Martínez rechazaron la recusación y la inhibición de la jueza Jazmín Ortiz. La defensa de Núñez recusó a la magistrada y, a su vez, esta pidió apartarse del proceso, alegando que sufre de "ataques mediáticos" debido a que sus padres, quienes se muestran cercanos al exgobernador, son la diputada Ida Cattebecke y el exintendente de Benjamín Aceval, Pedro Ortiz, del mismo movimiento político que Núñez.

En ese sentido, la Sala Penal consideró errónea la decisión de no hacer lugar a la inhibición de Ortiz, ya que esta, tras ser recusada en junio pasado, se allanó a la recusación y argumentó que la situación podría proyectar dudas acerca de su imparcialidad. Para los ministros Carolina Llanes y Luis María Benítez Riera, al no apartar a la jueza, los camaristas incurrieron en arbitrariedad y en un exceso de poder o ejercicio abusivo del mismo.

La Corte argumentó que los magistrados María Elena Meza y Gustavo Martínez excedieron los límites jurídicos en su función, sustituyendo la voluntad objetiva de la ley. Esto, ya que, una vez que el juez se allana a los términos de la recusación, se lo debe tener por inhibido de la causa. No obstante, mediante resolución N.º 112 del 19 de junio de 2026, los mismos rechazaron la inhibición de la magistrada Jazmín Ortiz.

Ante tal circunstancia, el Tribunal de segunda instancia queda con solo dos miembros y otro magistrado deberá conformar el colegiado, a fin de que este se expida sobre los recursos planteados por los condenados en la causa.

El hermano del senador Basilio "Bachi" Núñez fue sentenciado por causar un perjuicio patrimonial de Gs. 42.503.556.035 a la Gobernación de Presidente Hayes durante su gestión como gobernador. Según se probó en el juicio oral, habría utilizado dinero público para pagar deudas de campaña, carreras de caballos y deudas privadas, entre otras irregularidades en su administración.

En el mismo proceso, el exgobernador Emigdio Benítez, sucesor de Óscar «Ñoño» Núñez en la Gobernación, fue condenado a 7 años 6 meses por la mala administración al frente de la Gobernación, que habría causado un perjuicio de Gs.10.246.250.080.

De igual manera, fue condenada la exsecretaria de Administración y Finanzas de la Gobernación, Nancy Núñez de Roussillon, esposa del exgobernador y actual diputado Rubén Roussillon. La misma recibió 5 años de cárcel, más inhabilitación para el ejercicio de cargos públicos por 5 años.

Otro de los condenados fue Edulfo Verón, exsecretario de Administración de la Gobernación de Presidente Hayes, a 6 años de cárcel, más inhabilitación para el ejercicio de cargos públicos por 5 años. De igual manera, Raúl Delgado, funcionario de la Organización Paraguaya de Cooperación Intermunicipal (Opaci), fue condenado como cómplice por lesión de confianza a 3 años de cárcel.