Las fiscales Fátima Villasboa y Susana González lo acusaron y pidieron la elevación de la causa a juicio oral y público. Sostienen que sometió a violencia física y psicológica a su esposa y a su cuñada, episodios de agresión que causaron heridas principalmente a su cónyuge.

Recientemente una Cámara de Apelaciones, con voto en mayoría, revocó la prisión preventiva de Juan Villalba. Según el argumento esgrimido por los miembros de la alzada, la aplicación de medidas menos gravosas a la prisión preventiva sería suficiente para evitar el peligro de fuga y de obstrucción a la investigación penal.

Además de ello, hicieron énfasis en que el Ministerio Público debería acreditar el pedido de prisión preventiva con elementos de prueba que lo justifiquen, sin embargo, esto no fue cumplido por el órgano investigador.